微波殺菌機作為食品企業殺菌的主要設備之一，主要應用于真空包裝食品、熟食品、鹵肉、粉狀食品、營養粉、芝麻糊、藕粉、調味食品、豆腐乳、辣椒醬、甜面醬、罐頭食品、罐頭飲料等等。

許多食品都是包裝后再通過殺菌機殺菌的，那么什么樣包裝材料才適用微波殺菌機殺菌呢？適用于微波殺菌的包裝材料有：PP材料、高溫蒸煮袋、真空袋、四氟材料、PP復合材料、PE材料、玻璃瓶、陶瓷制品等等。不適于微波殺菌的包裝材料有：錫箔、鋁箔、易拉罐、罐頭、不耐高溫的塑料袋等等。

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